環保清淤包含兩個方面的含義，一方面指以水質改善為目標的清淤工程，另一方面則是在清淤過程中能夠盡可能避免對水體環境產生影響。

環保清淤的特點有: 

①清淤設備應具有較高的定位精度和挖掘精度，防止漏挖和超挖，不傷及原生土; 

②在清淤過程中，防止擾動和擴散，不造成水體的二次污染，降低水體的混濁度，控制施工機械的噪音，不干擾居民正常生活; 

③淤泥棄場要遠離居民區，防止途中運輸產生的二次污染。

環保清淤的關鍵和難點在于如何保證有效的清淤深度和位置，并進行有效的二次污染防治，為了達到這一目標一般使用清淤設備，如使用常規清淤設備時必須進行相應改進。設備包括螺旋式挖泥裝置和密閉旋轉斗輪挖泥設備。這兩種設備能夠在挖泥時阻斷水侵入土中，故可高濃度挖泥且極少發生污濁和擴散現象，幾乎不污染周圍水域。

國內目前所使用的環保清淤設備多為在普通挖泥船上對某些挖泥機具進行環保改造，并配備的高精度定位和監控系統以提高疏浚精度、減少疏浚過程中的二次污染，滿足環保清淤要求。

環保絞吸式清淤是目前常用的環保清淤方式，適用于工程量較大的大、中、小型河道、湖泊和水庫，多用于河道、湖泊和水庫的環保清淤工程。環保絞吸式清淤是利用環保絞吸式清淤船進行清淤。環保絞吸式清淤船配備的環保絞刀頭，清淤過程中，利用環保絞刀頭實施封閉式低擾動清淤，開挖后的淤泥通過挖泥船上的大功率泥泵吸入并進入輸泥管道，經全封閉管道輸送至卸泥區。

環保絞吸式清淤船配備的環保絞刀頭具有防止污染淤泥泄漏和擴散的功能，可以疏浚薄的污染底泥而且對底泥擾動小，避免了污染淤泥的擴散和逃淤現象，底泥清除率可達到95% 以上; 清淤濃度高，清淤泥漿質量分數達70% 以上，一次可挖泥厚度為20～110 cm。同時環保絞吸式挖泥船具有高精度定位技術和現場監控系統，通過模擬動畫，可直觀地觀察清淤設備的挖掘軌跡; 高程控制通過挖深指示儀和回聲測深儀，精確定位絞刀深度，挖掘精度高。